MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharobutylicum DSM 13864

Total Repeats: 108020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022571	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916529
2	NC_022571	CTATAT	2	12	201	212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550916529
3	NC_022571	TA	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	550916529
4	NC_022571	TAT	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916529
5	NC_022571	TCA	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916529
6	NC_022571	AATCAA	2	12	396	407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916529
7	NC_022571	ATG	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916529
8	NC_022571	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916529
9	NC_022571	ATT	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916529
10	NC_022571	TA	3	6	550	555	50 %	50 %	0 %	0 %	550916529
11	NC_022571	TGG	2	6	556	561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550916529
12	NC_022571	AGT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916529
13	NC_022571	TAA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916529
14	NC_022571	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916529
15	NC_022571	AAAT	2	8	712	719	75 %	25 %	0 %	0 %	550916529
16	NC_022571	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916529
17	NC_022571	T	6	6	791	796	0 %	100 %	0 %	0 %	550916529
18	NC_022571	ACC	2	6	853	858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550916529
19	NC_022571	AGA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916529
20	NC_022571	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	550916529
21	NC_022571	CAA	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916529
22	NC_022571	TAA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916529
23	NC_022571	AAT	2	6	1069	1074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916529
24	NC_022571	CTT	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550916529
25	NC_022571	ATATC	2	10	1137	1146	40 %	40 %	0 %	20 %	550916529
26	NC_022571	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	550916529
27	NC_022571	AGA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916529
28	NC_022571	AGA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916529
29	NC_022571	GAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916529
30	NC_022571	TAC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916529
31	NC_022571	A	6	6	1371	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	550916529
32	NC_022571	TGA	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916529
33	NC_022571	ACA	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916529
34	NC_022571	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	550916530
35	NC_022571	TA	3	6	1811	1816	50 %	50 %	0 %	0 %	550916530
36	NC_022571	ATCA	2	8	1828	1835	50 %	25 %	0 %	25 %	550916530
37	NC_022571	TAT	2	6	1895	1900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916530
38	NC_022571	AGA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916530
39	NC_022571	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916530
40	NC_022571	TAAAAA	2	12	2198	2209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550916530
41	NC_022571	GAT	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916530
42	NC_022571	AT	3	6	2374	2379	50 %	50 %	0 %	0 %	550916530
43	NC_022571	ATTTA	2	10	2381	2390	40 %	60 %	0 %	0 %	550916530
44	NC_022571	ATA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916530
45	NC_022571	ATT	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916530
46	NC_022571	TTA	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916530
47	NC_022571	GTTAAT	2	12	2475	2486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916530
48	NC_022571	ACA	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916530
49	NC_022571	CTAAT	2	10	2545	2554	40 %	40 %	0 %	20 %	550916530
50	NC_022571	CAA	2	6	2568	2573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916530
51	NC_022571	TAATT	2	10	2576	2585	40 %	60 %	0 %	0 %	550916530
52	NC_022571	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916530
53	NC_022571	TGA	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916530
54	NC_022571	AGA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916530
55	NC_022571	AGG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550916530
56	NC_022571	A	7	7	2847	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	550916531
57	NC_022571	AATAA	2	10	2856	2865	80 %	20 %	0 %	0 %	550916531
58	NC_022571	ATA	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916531
59	NC_022571	TA	4	8	2944	2951	50 %	50 %	0 %	0 %	550916531
60	NC_022571	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916531
61	NC_022571	A	7	7	2999	3005	100 %	0 %	0 %	0 %	550916531
62	NC_022571	TGT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916531
63	NC_022571	ATA	2	6	3051	3056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916531
64	NC_022571	ATGT	2	8	3128	3135	25 %	50 %	25 %	0 %	550916532
65	NC_022571	GTTA	2	8	3148	3155	25 %	50 %	25 %	0 %	550916532
66	NC_022571	TAT	2	6	3257	3262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
67	NC_022571	TAA	2	6	3306	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
68	NC_022571	TAGAT	2	10	3358	3367	40 %	40 %	20 %	0 %	550916532
69	NC_022571	A	7	7	3368	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	550916532
70	NC_022571	AT	3	6	3384	3389	50 %	50 %	0 %	0 %	550916532
71	NC_022571	ATT	2	6	3448	3453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
72	NC_022571	TGT	2	6	3466	3471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916532
73	NC_022571	AGA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916532
74	NC_022571	AAAT	2	8	3552	3559	75 %	25 %	0 %	0 %	550916532
75	NC_022571	ATT	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
76	NC_022571	ATA	2	6	3588	3593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
77	NC_022571	GAAA	2	8	3605	3612	75 %	0 %	25 %	0 %	550916532
78	NC_022571	AT	3	6	3656	3661	50 %	50 %	0 %	0 %	550916532
79	NC_022571	ATTAT	2	10	3687	3696	40 %	60 %	0 %	0 %	550916532
80	NC_022571	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	550916532
81	NC_022571	AGATA	2	10	3718	3727	60 %	20 %	20 %	0 %	550916532
82	NC_022571	GAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916532
83	NC_022571	AAAGA	2	10	3770	3779	80 %	0 %	20 %	0 %	550916532
84	NC_022571	TAA	2	6	3805	3810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
85	NC_022571	GAT	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916532
86	NC_022571	ATT	2	6	3831	3836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
87	NC_022571	ATA	2	6	3852	3857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
88	NC_022571	GAT	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916532
89	NC_022571	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
90	NC_022571	ATT	2	6	4007	4012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
91	NC_022571	TAT	2	6	4041	4046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
92	NC_022571	GAT	2	6	4049	4054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916532
93	NC_022571	A	7	7	4081	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	550916532
94	NC_022571	AAT	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916532
95	NC_022571	TGA	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916532
96	NC_022571	ATT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916532
97	NC_022571	GAT	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916532
98	NC_022571	TGT	2	6	4251	4256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916533
99	NC_022571	ATT	2	6	4273	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916533
100	NC_022571	ATACA	2	10	4316	4325	60 %	20 %	0 %	20 %	550916533
101	NC_022571	AGA	3	9	4341	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916533
102	NC_022571	TTG	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916533
103	NC_022571	AGA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916533
104	NC_022571	TAT	2	6	4392	4397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916533
105	NC_022571	ATA	2	6	4409	4414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916533
106	NC_022571	TATC	2	8	4426	4433	25 %	50 %	0 %	25 %	550916533
107	NC_022571	ATC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916533
108	NC_022571	AAGA	2	8	4604	4611	75 %	0 %	25 %	0 %	550916534
109	NC_022571	GTAT	2	8	4618	4625	25 %	50 %	25 %	0 %	550916534
110	NC_022571	TCA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916534
111	NC_022571	TTG	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916534
112	NC_022571	TGA	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916534
113	NC_022571	TGA	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916534
114	NC_022571	TAC	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916534
115	NC_022571	AGG	2	6	4844	4849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550916534
116	NC_022571	GGC	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550916534
117	NC_022571	GAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916534
118	NC_022571	AT	3	6	4960	4965	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
119	NC_022571	CAA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916534
120	NC_022571	GTAAGG	2	12	4981	4992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550916534
121	NC_022571	TGA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916534
122	NC_022571	CGA	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916534
123	NC_022571	TAAA	2	8	5131	5138	75 %	25 %	0 %	0 %	550916534
124	NC_022571	TA	4	8	5143	5150	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
125	NC_022571	AGA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916534
126	NC_022571	AAG	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916534
127	NC_022571	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916534
128	NC_022571	AT	4	8	5262	5269	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
129	NC_022571	ATA	2	6	5284	5289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916534
130	NC_022571	T	6	6	5338	5343	0 %	100 %	0 %	0 %	550916534
131	NC_022571	ATA	2	6	5353	5358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916534
132	NC_022571	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916534
133	NC_022571	AAACTA	2	12	5545	5556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916534
134	NC_022571	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550916534
135	NC_022571	ATA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916534
136	NC_022571	AGCTAG	2	12	5675	5686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550916534
137	NC_022571	TGC	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916534
138	NC_022571	AT	4	8	5796	5803	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
139	NC_022571	TGG	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550916534
140	NC_022571	GAA	2	6	5842	5847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916534
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142	NC_022571	ATA	2	6	6004	6009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916534
143	NC_022571	TAA	2	6	6016	6021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916534
144	NC_022571	TTA	3	9	6060	6068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916534
145	NC_022571	AT	3	6	6083	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
146	NC_022571	ACC	2	6	6128	6133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550916534
147	NC_022571	TA	3	6	6136	6141	50 %	50 %	0 %	0 %	550916534
148	NC_022571	A	6	6	6156	6161	100 %	0 %	0 %	0 %	550916534
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153	NC_022571	GCA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916534
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157	NC_022571	A	6	6	6521	6526	100 %	0 %	0 %	0 %	550916535
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164	NC_022571	GA	3	6	6874	6879	50 %	0 %	50 %	0 %	550916535
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174	NC_022571	AG	3	6	7386	7391	50 %	0 %	50 %	0 %	550916535
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246	NC_022571	AGC	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550916537
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251	NC_022571	GTTG	2	8	15834	15841	0 %	50 %	50 %	0 %	550916538
252	NC_022571	ATATA	2	10	15866	15875	60 %	40 %	0 %	0 %	550916538
253	NC_022571	ATG	2	6	15913	15918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916538
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256	NC_022571	TTC	2	6	16067	16072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550916538
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259	NC_022571	TGC	2	6	16271	16276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550916538
260	NC_022571	AGA	3	9	16301	16309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916538
261	NC_022571	AAC	2	6	16349	16354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550916538
262	NC_022571	TAA	2	6	16355	16360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916538
263	NC_022571	AATAC	2	10	16389	16398	60 %	20 %	0 %	20 %	550916538
264	NC_022571	TAA	2	6	16444	16449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550916538
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397	NC_022571	GAA	2	6	23897	23902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916542
398	NC_022571	GATAG	2	10	23905	23914	40 %	20 %	40 %	0 %	550916542
399	NC_022571	TTAGAT	2	12	23920	23931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916542
400	NC_022571	TTTA	2	8	24026	24033	25 %	75 %	0 %	0 %	550916542
401	NC_022571	TTAA	2	8	24040	24047	50 %	50 %	0 %	0 %	550916542
402	NC_022571	AT	4	8	24057	24064	50 %	50 %	0 %	0 %	550916542
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